福建省交通基本建设工程质量监督站始建于1988年，为副处级事业单位，1991年通过交通部的考核验收。1994年福建省交通基本建设工程质量监督站与福建省交通建设工程监理站（正处级事业单位）分别从省科研所、省公路局分离后合并。两站核编65人，其中质监站20人，监理站45人。现设有总工室、公路工程部、水运工程部、检测室、资质管理部、财务部、人教部、政工部、办公室等九个科室，共有在编人员63人，其中具有大专以上学历的57人，占职工总人数的90%，具有高级职称的18人，中级职称的18人，初级职称的10人，各类专业人员占职工总人数的75%。

两站专业齐备，技术力量雄厚，仪器设备精良，坚持"严格监督，热情服务，秉公执法，求实公正"为宗旨，对全省高速公路、大中型水运工程等几十个国家、省重点工程项目实施质量监督，为交通建设工程质量的稳步提高作出了积极的贡献。两个文明建设成绩显著，先后荣获省人事厅、省交通厅"先进集体"、省直党工委"先进基层党组织"、省直机关"第七届、第八届文明单位"、省直工委"先进职工之家"、交通系统行政执法工作先进单位、交通系统效能建设先进集体、同三线福宁高速公路建设先进单位、入闽通道建设项目优秀组织奖等荣誉称号。